Protein–RNA interactions for Protein: P33146

Cdh15, Cadherin-15, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh15P33146 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdh15P33146 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdh15P33146 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdh15P33146 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdh15P33146 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdh15P33146 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdh15P33146 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdh15P33146 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdh15P33146 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdh15P33146 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdh15P33146 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdh15P33146 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdh15P33146 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdh15P33146 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdh15P33146 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdh15P33146 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdh15P33146 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdh15P33146 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdh15P33146 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdh15P33146 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdh15P33146 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdh15P33146 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdh15P33146 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdh15P33146 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdh15P33146 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdh15P33146 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdh15P33146 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdh15P33146 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdh15P33146 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdh15P33146 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdh15P33146 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdh15P33146 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdh15P33146 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdh15P33146 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdh15P33146 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdh15P33146 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdh15P33146 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdh15P33146 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdh15P33146 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdh15P33146 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdh15P33146 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdh15P33146 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdh15P33146 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdh15P33146 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdh15P33146 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdh15P33146 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdh15P33146 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdh15P33146 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdh15P33146 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdh15P33146 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdh15P33146 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdh15P33146 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdh15P33146 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdh15P33146 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdh15P33146 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms