Protein–RNA interactions for Protein: P28563

Dusp1, Dual specificity protein phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp1P28563 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dusp1P28563 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms