Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Col2a1P28481 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Col2a1P28481 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Col2a1P28481 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Col2a1P28481 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Col2a1P28481 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col2a1P28481 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col2a1P28481 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col2a1P28481 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col2a1P28481 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col2a1P28481 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col2a1P28481 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col2a1P28481 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Col2a1P28481 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col2a1P28481 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col2a1P28481 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col2a1P28481 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col2a1P28481 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col2a1P28481 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col2a1P28481 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col2a1P28481 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col2a1P28481 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Col2a1P28481 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col2a1P28481 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col2a1P28481 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col2a1P28481 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col2a1P28481 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col2a1P28481 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col2a1P28481 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col2a1P28481 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col2a1P28481 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col2a1P28481 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col2a1P28481 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col2a1P28481 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col2a1P28481 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col2a1P28481 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col2a1P28481 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col2a1P28481 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col2a1P28481 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col2a1P28481 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col2a1P28481 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col2a1P28481 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col2a1P28481 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col2a1P28481 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms