Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
U2af2P26369 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
U2af2P26369 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
U2af2P26369 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
U2af2P26369 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
U2af2P26369 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
U2af2P26369 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
U2af2P26369 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
U2af2P26369 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
U2af2P26369 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
U2af2P26369 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
U2af2P26369 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
U2af2P26369 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
U2af2P26369 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
U2af2P26369 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
U2af2P26369 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
U2af2P26369 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
U2af2P26369 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
U2af2P26369 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
U2af2P26369 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
U2af2P26369 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
U2af2P26369 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
U2af2P26369 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
U2af2P26369 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
U2af2P26369 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
U2af2P26369 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
U2af2P26369 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
U2af2P26369 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms