Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gria1P23818 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gria1P23818 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gria1P23818 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gria1P23818 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gria1P23818 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gria1P23818 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gria1P23818 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms