Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Csn1s1P19228 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csn1s1P19228 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms