Protein–RNA interactions for Protein: P18828

Sdc1, Syndecan-1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc1P18828 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms