Protein–RNA interactions for Protein: P18074

ERCC2, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPD subunit, humanhuman

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC2P18074 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC2P18074 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms