Protein–RNA interactions for Protein: P0DP28

Calm3, Calmodulin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm3P0DP28 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Calm3P0DP28 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Calm3P0DP28 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Calm3P0DP28 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Calm3P0DP28 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Calm3P0DP28 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Calm3P0DP28 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Calm3P0DP28 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Calm3P0DP28 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Calm3P0DP28 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calm3P0DP28 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calm3P0DP28 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calm3P0DP28 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calm3P0DP28 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calm3P0DP28 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calm3P0DP28 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calm3P0DP28 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calm3P0DP28 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calm3P0DP28 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calm3P0DP28 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calm3P0DP28 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calm3P0DP28 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calm3P0DP28 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Calm3P0DP28 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Calm3P0DP28 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Calm3P0DP28 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Calm3P0DP28 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Calm3P0DP28 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Calm3P0DP28 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Calm3P0DP28 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Calm3P0DP28 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Calm3P0DP28 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Calm3P0DP28 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Calm3P0DP28 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Calm3P0DP28 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Calm3P0DP28 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Calm3P0DP28 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Calm3P0DP28 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Calm3P0DP28 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Calm3P0DP28 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Calm3P0DP28 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Calm3P0DP28 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Calm3P0DP28 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Calm3P0DP28 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Calm3P0DP28 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Calm3P0DP28 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Calm3P0DP28 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Calm3P0DP28 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Calm3P0DP28 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Calm3P0DP28 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Calm3P0DP28 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Calm3P0DP28 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Calm3P0DP28 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Calm3P0DP28 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Calm3P0DP28 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Calm3P0DP28 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Calm3P0DP28 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Calm3P0DP28 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Calm3P0DP28 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Calm3P0DP28 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Calm3P0DP28 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Calm3P0DP28 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Calm3P0DP28 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Calm3P0DP28 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Calm3P0DP28 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Calm3P0DP28 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Calm3P0DP28 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Calm3P0DP28 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Calm3P0DP28 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Calm3P0DP28 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Calm3P0DP28 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Calm3P0DP28 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Calm3P0DP28 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Calm3P0DP28 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Calm3P0DP28 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Calm3P0DP28 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Calm3P0DP28 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Calm3P0DP28 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Calm3P0DP28 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Calm3P0DP28 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Calm3P0DP28 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Calm3P0DP28 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Calm3P0DP28 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Calm3P0DP28 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Calm3P0DP28 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Calm3P0DP28 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Calm3P0DP28 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Calm3P0DP28 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Calm3P0DP28 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Calm3P0DP28 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Calm3P0DP28 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Calm3P0DP28 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Calm3P0DP28 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Calm3P0DP28 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Calm3P0DP28 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Calm3P0DP28 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Calm3P0DP28 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Calm3P0DP28 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Calm3P0DP28 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Calm3P0DP28 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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