Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxa4P06798 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxa4P06798 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxa4P06798 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxa4P06798 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxa4P06798 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxa4P06798 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxa4P06798 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxa4P06798 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxa4P06798 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxa4P06798 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxa4P06798 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxa4P06798 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxa4P06798 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxa4P06798 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxa4P06798 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxa4P06798 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxa4P06798 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxa4P06798 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxa4P06798 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxa4P06798 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxa4P06798 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxa4P06798 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxa4P06798 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxa4P06798 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxa4P06798 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxa4P06798 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxa4P06798 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxa4P06798 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxa4P06798 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxa4P06798 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxa4P06798 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxa4P06798 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxa4P06798 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxa4P06798 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxa4P06798 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxa4P06798 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxa4P06798 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxa4P06798 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxa4P06798 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxa4P06798 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxa4P06798 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Hoxa4P06798 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Hoxa4P06798 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Hoxa4P06798 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Hoxa4P06798 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxa4P06798 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxa4P06798 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxa4P06798 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxa4P06798 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxa4P06798 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxa4P06798 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxa4P06798 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxa4P06798 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxa4P06798 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxa4P06798 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxa4P06798 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxa4P06798 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxa4P06798 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxa4P06798 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxa4P06798 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxa4P06798 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxa4P06798 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxa4P06798 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxa4P06798 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxa4P06798 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxa4P06798 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxa4P06798 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxa4P06798 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxa4P06798 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxa4P06798 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxa4P06798 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxa4P06798 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxa4P06798 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxa4P06798 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxa4P06798 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxa4P06798 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxa4P06798 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxa4P06798 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxa4P06798 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxa4P06798 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxa4P06798 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxa4P06798 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxa4P06798 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxa4P06798 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxa4P06798 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxa4P06798 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxa4P06798 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxa4P06798 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxa4P06798 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxa4P06798 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxa4P06798 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxa4P06798 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxa4P06798 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxa4P06798 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxa4P06798 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxa4P06798 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxa4P06798 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxa4P06798 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxa4P06798 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms