Protein–RNA interactions for Protein: P04187

Gzmb, Granzyme B(G,H), mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GzmbP04187 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GzmbP04187 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GzmbP04187 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GzmbP04187 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GzmbP04187 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GzmbP04187 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GzmbP04187 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GzmbP04187 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GzmbP04187 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GzmbP04187 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GzmbP04187 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GzmbP04187 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GzmbP04187 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GzmbP04187 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GzmbP04187 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GzmbP04187 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GzmbP04187 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GzmbP04187 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GzmbP04187 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GzmbP04187 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GzmbP04187 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GzmbP04187 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GzmbP04187 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GzmbP04187 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GzmbP04187 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GzmbP04187 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GzmbP04187 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GzmbP04187 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GzmbP04187 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GzmbP04187 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GzmbP04187 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GzmbP04187 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GzmbP04187 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GzmbP04187 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GzmbP04187 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GzmbP04187 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GzmbP04187 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GzmbP04187 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GzmbP04187 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GzmbP04187 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GzmbP04187 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GzmbP04187 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GzmbP04187 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GzmbP04187 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GzmbP04187 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GzmbP04187 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GzmbP04187 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GzmbP04187 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GzmbP04187 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GzmbP04187 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GzmbP04187 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GzmbP04187 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GzmbP04187 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GzmbP04187 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GzmbP04187 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GzmbP04187 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GzmbP04187 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GzmbP04187 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GzmbP04187 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GzmbP04187 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GzmbP04187 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GzmbP04187 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GzmbP04187 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GzmbP04187 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GzmbP04187 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GzmbP04187 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GzmbP04187 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GzmbP04187 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GzmbP04187 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GzmbP04187 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GzmbP04187 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GzmbP04187 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GzmbP04187 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GzmbP04187 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GzmbP04187 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GzmbP04187 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GzmbP04187 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GzmbP04187 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GzmbP04187 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GzmbP04187 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GzmbP04187 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GzmbP04187 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GzmbP04187 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GzmbP04187 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GzmbP04187 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GzmbP04187 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GzmbP04187 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GzmbP04187 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GzmbP04187 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GzmbP04187 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GzmbP04187 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GzmbP04187 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GzmbP04187 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GzmbP04187 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GzmbP04187 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GzmbP04187 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GzmbP04187 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GzmbP04187 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GzmbP04187 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GzmbP04187 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms