Protein–RNA interactions for Protein: P01910

H2-Aa, H-2 class II histocompatibility antigen, A-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-AaP01910 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-AaP01910 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms