Protein–RNA interactions for Protein: P00687

Amy1, Alpha-amylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amy1P00687 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Amy1P00687 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Amy1P00687 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Amy1P00687 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Amy1P00687 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Amy1P00687 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Amy1P00687 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Amy1P00687 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms