Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cbx4O55187 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cbx4O55187 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cbx4O55187 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cbx4O55187 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cbx4O55187 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cbx4O55187 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbx4O55187 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbx4O55187 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbx4O55187 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbx4O55187 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbx4O55187 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbx4O55187 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbx4O55187 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbx4O55187 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbx4O55187 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbx4O55187 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbx4O55187 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbx4O55187 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbx4O55187 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbx4O55187 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbx4O55187 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbx4O55187 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbx4O55187 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbx4O55187 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbx4O55187 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbx4O55187 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbx4O55187 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cbx4O55187 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cbx4O55187 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cbx4O55187 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cbx4O55187 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cbx4O55187 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cbx4O55187 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cbx4O55187 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cbx4O55187 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cbx4O55187 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cbx4O55187 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cbx4O55187 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cbx4O55187 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cbx4O55187 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cbx4O55187 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbx4O55187 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbx4O55187 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbx4O55187 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbx4O55187 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbx4O55187 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbx4O55187 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbx4O55187 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbx4O55187 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbx4O55187 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbx4O55187 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbx4O55187 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbx4O55187 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cbx4O55187 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cbx4O55187 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cbx4O55187 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cbx4O55187 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cbx4O55187 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cbx4O55187 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cbx4O55187 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cbx4O55187 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cbx4O55187 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cbx4O55187 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cbx4O55187 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cbx4O55187 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms