Protein–RNA interactions for Protein: O35739

Klf9, Krueppel-like factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf9O35739 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf9O35739 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf9O35739 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Klf9O35739 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf9O35739 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf9O35739 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms