Protein–RNA interactions for Protein: O35308

Slc16a8, Monocarboxylate transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc16a8O35308 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc16a8O35308 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc16a8O35308 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc16a8O35308 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc16a8O35308 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc16a8O35308 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc16a8O35308 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc16a8O35308 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc16a8O35308 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc16a8O35308 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc16a8O35308 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc16a8O35308 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc16a8O35308 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc16a8O35308 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc16a8O35308 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc16a8O35308 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc16a8O35308 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc16a8O35308 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc16a8O35308 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc16a8O35308 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc16a8O35308 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc16a8O35308 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc16a8O35308 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc16a8O35308 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc16a8O35308 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc16a8O35308 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc16a8O35308 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc16a8O35308 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc16a8O35308 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc16a8O35308 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc16a8O35308 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc16a8O35308 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc16a8O35308 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc16a8O35308 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc16a8O35308 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc16a8O35308 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc16a8O35308 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc16a8O35308 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc16a8O35308 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc16a8O35308 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc16a8O35308 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc16a8O35308 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc16a8O35308 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc16a8O35308 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc16a8O35308 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc16a8O35308 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc16a8O35308 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc16a8O35308 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc16a8O35308 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc16a8O35308 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc16a8O35308 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc16a8O35308 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc16a8O35308 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc16a8O35308 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc16a8O35308 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc16a8O35308 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc16a8O35308 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc16a8O35308 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc16a8O35308 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc16a8O35308 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc16a8O35308 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc16a8O35308 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc16a8O35308 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc16a8O35308 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc16a8O35308 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc16a8O35308 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc16a8O35308 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc16a8O35308 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc16a8O35308 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc16a8O35308 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc16a8O35308 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc16a8O35308 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc16a8O35308 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc16a8O35308 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc16a8O35308 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc16a8O35308 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc16a8O35308 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc16a8O35308 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc16a8O35308 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc16a8O35308 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc16a8O35308 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc16a8O35308 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc16a8O35308 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc16a8O35308 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc16a8O35308 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc16a8O35308 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc16a8O35308 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc16a8O35308 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc16a8O35308 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc16a8O35308 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc16a8O35308 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc16a8O35308 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc16a8O35308 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc16a8O35308 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc16a8O35308 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc16a8O35308 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc16a8O35308 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc16a8O35308 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc16a8O35308 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc16a8O35308 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms