Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-Q1O19441 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-Q1O19441 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-Q1O19441 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-Q1O19441 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-Q1O19441 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-Q1O19441 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-Q1O19441 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-Q1O19441 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-Q1O19441 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-Q1O19441 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-Q1O19441 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-Q1O19441 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-Q1O19441 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-Q1O19441 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-Q1O19441 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-Q1O19441 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-Q1O19441 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-Q1O19441 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-Q1O19441 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-Q1O19441 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-Q1O19441 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-Q1O19441 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-Q1O19441 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-Q1O19441 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-Q1O19441 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-Q1O19441 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-Q1O19441 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-Q1O19441 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-Q1O19441 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-Q1O19441 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-Q1O19441 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-Q1O19441 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-Q1O19441 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-Q1O19441 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-Q1O19441 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-Q1O19441 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-Q1O19441 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
H2-Q1O19441 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-Q1O19441 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-Q1O19441 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-Q1O19441 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-Q1O19441 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-Q1O19441 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-Q1O19441 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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H2-Q1O19441 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-Q1O19441 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-Q1O19441 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-Q1O19441 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-Q1O19441 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-Q1O19441 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-Q1O19441 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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H2-Q1O19441 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-Q1O19441 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-Q1O19441 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-Q1O19441 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-Q1O19441 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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H2-Q1O19441 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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H2-Q1O19441 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-Q1O19441 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-Q1O19441 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-Q1O19441 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-Q1O19441 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-Q1O19441 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-Q1O19441 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-Q1O19441 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-Q1O19441 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-Q1O19441 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-Q1O19441 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-Q1O19441 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-Q1O19441 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-Q1O19441 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-Q1O19441 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-Q1O19441 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-Q1O19441 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-Q1O19441 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-Q1O19441 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-Q1O19441 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-Q1O19441 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-Q1O19441 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-Q1O19441 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-Q1O19441 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-Q1O19441 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-Q1O19441 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-Q1O19441 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-Q1O19441 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-Q1O19441 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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