Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM6AO15550 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM6AO15550 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM6AO15550 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM6AO15550 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
KDM6AO15550 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM6AO15550 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM6AO15550 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM6AO15550 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM6AO15550 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM6AO15550 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM6AO15550 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM6AO15550 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM6AO15550 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM6AO15550 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM6AO15550 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM6AO15550 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
KDM6AO15550 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KDM6AO15550 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
KDM6AO15550 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms