Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21310J3QQ23 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21310J3QQ23 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21310J3QQ23 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21310J3QQ23 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21310J3QQ23 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21310J3QQ23 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Gm21310J3QQ23 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Gm21310J3QQ23 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm21310J3QQ23 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm21310J3QQ23 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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Gm21310J3QQ23 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21310J3QQ23 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21310J3QQ23 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21310J3QQ23 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21310J3QQ23 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21310J3QQ23 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21310J3QQ23 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21310J3QQ23 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21310J3QQ23 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21310J3QQ23 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21310J3QQ23 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21310J3QQ23 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21310J3QQ23 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21310J3QQ23 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21310J3QQ23 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21310J3QQ23 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21310J3QQ23 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21310J3QQ23 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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