Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp9yF8VPU6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms