Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0V3

Vmn1r68, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r68E9Q0V3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r68E9Q0V3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r68E9Q0V3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms