Protein–RNA interactions for Protein: E5RIL1

UPK3BL2, Uroplakin-3b-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BL2E5RIL1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
UPK3BL2E5RIL1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms