Protein–RNA interactions for Protein: D3YXJ9

Cldn24, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn24D3YXJ9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn24D3YXJ9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn24D3YXJ9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn24D3YXJ9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn24D3YXJ9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn24D3YXJ9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn24D3YXJ9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn24D3YXJ9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn24D3YXJ9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn24D3YXJ9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn24D3YXJ9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn24D3YXJ9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn24D3YXJ9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn24D3YXJ9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn24D3YXJ9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn24D3YXJ9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn24D3YXJ9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn24D3YXJ9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn24D3YXJ9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn24D3YXJ9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn24D3YXJ9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn24D3YXJ9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn24D3YXJ9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn24D3YXJ9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn24D3YXJ9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn24D3YXJ9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn24D3YXJ9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn24D3YXJ9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn24D3YXJ9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn24D3YXJ9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn24D3YXJ9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn24D3YXJ9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn24D3YXJ9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn24D3YXJ9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn24D3YXJ9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn24D3YXJ9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn24D3YXJ9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn24D3YXJ9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn24D3YXJ9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn24D3YXJ9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn24D3YXJ9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn24D3YXJ9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn24D3YXJ9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn24D3YXJ9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn24D3YXJ9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn24D3YXJ9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn24D3YXJ9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn24D3YXJ9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn24D3YXJ9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn24D3YXJ9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn24D3YXJ9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn24D3YXJ9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn24D3YXJ9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms