Protein–RNA interactions for Protein: B9UIU9

Gm17660, Predicted gene, 17660, mousemouse

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17660B9UIU9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17660B9UIU9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17660B9UIU9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm17660B9UIU9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17660B9UIU9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17660B9UIU9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17660B9UIU9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17660B9UIU9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17660B9UIU9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17660B9UIU9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17660B9UIU9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17660B9UIU9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17660B9UIU9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17660B9UIU9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17660B9UIU9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17660B9UIU9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17660B9UIU9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17660B9UIU9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17660B9UIU9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17660B9UIU9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17660B9UIU9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17660B9UIU9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17660B9UIU9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17660B9UIU9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17660B9UIU9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17660B9UIU9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17660B9UIU9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17660B9UIU9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17660B9UIU9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17660B9UIU9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17660B9UIU9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17660B9UIU9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17660B9UIU9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17660B9UIU9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17660B9UIU9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17660B9UIU9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17660B9UIU9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17660B9UIU9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm17660B9UIU9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm17660B9UIU9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm17660B9UIU9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm17660B9UIU9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17660B9UIU9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17660B9UIU9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm17660B9UIU9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17660B9UIU9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17660B9UIU9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17660B9UIU9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17660B9UIU9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17660B9UIU9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17660B9UIU9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17660B9UIU9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17660B9UIU9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17660B9UIU9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17660B9UIU9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17660B9UIU9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17660B9UIU9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17660B9UIU9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17660B9UIU9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17660B9UIU9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17660B9UIU9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17660B9UIU9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17660B9UIU9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17660B9UIU9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17660B9UIU9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17660B9UIU9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17660B9UIU9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17660B9UIU9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17660B9UIU9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17660B9UIU9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17660B9UIU9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17660B9UIU9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17660B9UIU9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17660B9UIU9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17660B9UIU9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17660B9UIU9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17660B9UIU9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17660B9UIU9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17660B9UIU9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17660B9UIU9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17660B9UIU9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17660B9UIU9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17660B9UIU9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17660B9UIU9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17660B9UIU9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17660B9UIU9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17660B9UIU9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17660B9UIU9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17660B9UIU9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17660B9UIU9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm17660B9UIU9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm17660B9UIU9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm17660B9UIU9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm17660B9UIU9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm17660B9UIU9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm17660B9UIU9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17660B9UIU9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17660B9UIU9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17660B9UIU9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17660B9UIU9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms