Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syce3B5KM66 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syce3B5KM66 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syce3B5KM66 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syce3B5KM66 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syce3B5KM66 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syce3B5KM66 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syce3B5KM66 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syce3B5KM66 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syce3B5KM66 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syce3B5KM66 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syce3B5KM66 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syce3B5KM66 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syce3B5KM66 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syce3B5KM66 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syce3B5KM66 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syce3B5KM66 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syce3B5KM66 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syce3B5KM66 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syce3B5KM66 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syce3B5KM66 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syce3B5KM66 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syce3B5KM66 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syce3B5KM66 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syce3B5KM66 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syce3B5KM66 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syce3B5KM66 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syce3B5KM66 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syce3B5KM66 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syce3B5KM66 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Syce3B5KM66 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syce3B5KM66 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syce3B5KM66 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syce3B5KM66 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syce3B5KM66 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syce3B5KM66 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syce3B5KM66 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syce3B5KM66 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syce3B5KM66 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Syce3B5KM66 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syce3B5KM66 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syce3B5KM66 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syce3B5KM66 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syce3B5KM66 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Syce3B5KM66 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syce3B5KM66 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Syce3B5KM66 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syce3B5KM66 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Syce3B5KM66 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syce3B5KM66 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syce3B5KM66 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syce3B5KM66 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syce3B5KM66 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syce3B5KM66 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syce3B5KM66 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syce3B5KM66 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Syce3B5KM66 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syce3B5KM66 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syce3B5KM66 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syce3B5KM66 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syce3B5KM66 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syce3B5KM66 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syce3B5KM66 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syce3B5KM66 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syce3B5KM66 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syce3B5KM66 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syce3B5KM66 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Syce3B5KM66 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syce3B5KM66 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syce3B5KM66 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syce3B5KM66 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syce3B5KM66 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syce3B5KM66 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syce3B5KM66 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syce3B5KM66 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syce3B5KM66 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syce3B5KM66 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syce3B5KM66 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syce3B5KM66 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syce3B5KM66 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syce3B5KM66 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syce3B5KM66 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Syce3B5KM66 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syce3B5KM66 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syce3B5KM66 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syce3B5KM66 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syce3B5KM66 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syce3B5KM66 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syce3B5KM66 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syce3B5KM66 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syce3B5KM66 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syce3B5KM66 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syce3B5KM66 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syce3B5KM66 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syce3B5KM66 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syce3B5KM66 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syce3B5KM66 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syce3B5KM66 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syce3B5KM66 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syce3B5KM66 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms