Protein–RNA interactions for Protein: A7XUX6

Skint2, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint2A7XUX6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms