Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Pramef6A2A8M8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pramef6A2A8M8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pramef6A2A8M8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pramef6A2A8M8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pramef6A2A8M8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pramef6A2A8M8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pramef6A2A8M8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pramef6A2A8M8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pramef6A2A8M8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pramef6A2A8M8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pramef6A2A8M8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pramef6A2A8M8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pramef6A2A8M8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pramef6A2A8M8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pramef6A2A8M8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pramef6A2A8M8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pramef6A2A8M8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pramef6A2A8M8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pramef6A2A8M8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pramef6A2A8M8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pramef6A2A8M8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pramef6A2A8M8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pramef6A2A8M8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pramef6A2A8M8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pramef6A2A8M8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Pramef6A2A8M8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pramef6A2A8M8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pramef6A2A8M8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pramef6A2A8M8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pramef6A2A8M8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pramef6A2A8M8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pramef6A2A8M8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pramef6A2A8M8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pramef6A2A8M8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pramef6A2A8M8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pramef6A2A8M8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pramef6A2A8M8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pramef6A2A8M8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pramef6A2A8M8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Pramef6A2A8M8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pramef6A2A8M8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pramef6A2A8M8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pramef6A2A8M8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pramef6A2A8M8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pramef6A2A8M8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pramef6A2A8M8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pramef6A2A8M8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pramef6A2A8M8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pramef6A2A8M8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pramef6A2A8M8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pramef6A2A8M8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pramef6A2A8M8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pramef6A2A8M8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pramef6A2A8M8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pramef6A2A8M8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pramef6A2A8M8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pramef6A2A8M8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pramef6A2A8M8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pramef6A2A8M8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pramef6A2A8M8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pramef6A2A8M8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pramef6A2A8M8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pramef6A2A8M8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pramef6A2A8M8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pramef6A2A8M8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pramef6A2A8M8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pramef6A2A8M8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pramef6A2A8M8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pramef6A2A8M8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pramef6A2A8M8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pramef6A2A8M8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pramef6A2A8M8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pramef6A2A8M8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pramef6A2A8M8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pramef6A2A8M8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pramef6A2A8M8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pramef6A2A8M8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pramef6A2A8M8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pramef6A2A8M8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pramef6A2A8M8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pramef6A2A8M8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pramef6A2A8M8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pramef6A2A8M8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pramef6A2A8M8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pramef6A2A8M8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pramef6A2A8M8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pramef6A2A8M8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pramef6A2A8M8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pramef6A2A8M8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Pramef6A2A8M8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Pramef6A2A8M8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pramef6A2A8M8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pramef6A2A8M8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pramef6A2A8M8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pramef6A2A8M8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pramef6A2A8M8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Pramef6A2A8M8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pramef6A2A8M8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pramef6A2A8M8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms