Protein–RNA interactions for Protein: A2A432

Cul4b, Cullin-4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 970 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4bA2A432 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cul4bA2A432 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cul4bA2A432 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cul4bA2A432 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cul4bA2A432 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cul4bA2A432 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cul4bA2A432 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cul4bA2A432 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cul4bA2A432 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cul4bA2A432 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cul4bA2A432 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cul4bA2A432 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cul4bA2A432 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cul4bA2A432 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cul4bA2A432 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cul4bA2A432 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cul4bA2A432 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cul4bA2A432 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cul4bA2A432 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cul4bA2A432 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cul4bA2A432 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cul4bA2A432 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Cul4bA2A432 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cul4bA2A432 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cul4bA2A432 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cul4bA2A432 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cul4bA2A432 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cul4bA2A432 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cul4bA2A432 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cul4bA2A432 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cul4bA2A432 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cul4bA2A432 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cul4bA2A432 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cul4bA2A432 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cul4bA2A432 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cul4bA2A432 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Cul4bA2A432 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cul4bA2A432 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cul4bA2A432 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cul4bA2A432 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cul4bA2A432 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cul4bA2A432 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cul4bA2A432 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cul4bA2A432 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cul4bA2A432 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cul4bA2A432 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Cul4bA2A432 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cul4bA2A432 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cul4bA2A432 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cul4bA2A432 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Cul4bA2A432 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms