Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ilf3Q9Z1X4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ilf3Q9Z1X4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ilf3Q9Z1X4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ilf3Q9Z1X4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ilf3Q9Z1X4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ilf3Q9Z1X4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ilf3Q9Z1X4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ilf3Q9Z1X4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ilf3Q9Z1X4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ilf3Q9Z1X4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ilf3Q9Z1X4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ilf3Q9Z1X4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ilf3Q9Z1X4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ilf3Q9Z1X4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ilf3Q9Z1X4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ilf3Q9Z1X4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ilf3Q9Z1X4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ilf3Q9Z1X4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ilf3Q9Z1X4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ilf3Q9Z1X4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ilf3Q9Z1X4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ilf3Q9Z1X4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ilf3Q9Z1X4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ilf3Q9Z1X4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ilf3Q9Z1X4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ilf3Q9Z1X4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ilf3Q9Z1X4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ilf3Q9Z1X4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ilf3Q9Z1X4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ilf3Q9Z1X4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ilf3Q9Z1X4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ilf3Q9Z1X4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ilf3Q9Z1X4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ilf3Q9Z1X4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ilf3Q9Z1X4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ilf3Q9Z1X4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ilf3Q9Z1X4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ilf3Q9Z1X4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ilf3Q9Z1X4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ilf3Q9Z1X4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ilf3Q9Z1X4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ilf3Q9Z1X4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ilf3Q9Z1X4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ilf3Q9Z1X4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ilf3Q9Z1X4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ilf3Q9Z1X4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ilf3Q9Z1X4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ilf3Q9Z1X4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ilf3Q9Z1X4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ilf3Q9Z1X4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ilf3Q9Z1X4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ilf3Q9Z1X4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ilf3Q9Z1X4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ilf3Q9Z1X4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ilf3Q9Z1X4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ilf3Q9Z1X4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ilf3Q9Z1X4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ilf3Q9Z1X4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ilf3Q9Z1X4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ilf3Q9Z1X4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ilf3Q9Z1X4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ilf3Q9Z1X4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ilf3Q9Z1X4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ilf3Q9Z1X4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ilf3Q9Z1X4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ilf3Q9Z1X4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ilf3Q9Z1X4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ilf3Q9Z1X4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms