Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF8

PI4KB, Phosphatidylinositol 4-kinase beta, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4KBQ9UBF8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PI4KBQ9UBF8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PI4KBQ9UBF8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PI4KBQ9UBF8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PI4KBQ9UBF8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PI4KBQ9UBF8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PI4KBQ9UBF8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PI4KBQ9UBF8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PI4KBQ9UBF8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PI4KBQ9UBF8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PI4KBQ9UBF8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PI4KBQ9UBF8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PI4KBQ9UBF8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PI4KBQ9UBF8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PI4KBQ9UBF8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PI4KBQ9UBF8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PI4KBQ9UBF8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PI4KBQ9UBF8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PI4KBQ9UBF8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PI4KBQ9UBF8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PI4KBQ9UBF8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PI4KBQ9UBF8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PI4KBQ9UBF8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PI4KBQ9UBF8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PI4KBQ9UBF8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PI4KBQ9UBF8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PI4KBQ9UBF8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PI4KBQ9UBF8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PI4KBQ9UBF8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PI4KBQ9UBF8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PI4KBQ9UBF8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PI4KBQ9UBF8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PI4KBQ9UBF8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PI4KBQ9UBF8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PI4KBQ9UBF8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PI4KBQ9UBF8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PI4KBQ9UBF8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PI4KBQ9UBF8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PI4KBQ9UBF8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PI4KBQ9UBF8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PI4KBQ9UBF8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PI4KBQ9UBF8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PI4KBQ9UBF8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PI4KBQ9UBF8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PI4KBQ9UBF8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PI4KBQ9UBF8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PI4KBQ9UBF8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PI4KBQ9UBF8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PI4KBQ9UBF8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PI4KBQ9UBF8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PI4KBQ9UBF8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PI4KBQ9UBF8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PI4KBQ9UBF8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PI4KBQ9UBF8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PI4KBQ9UBF8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PI4KBQ9UBF8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PI4KBQ9UBF8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PI4KBQ9UBF8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PI4KBQ9UBF8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PI4KBQ9UBF8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PI4KBQ9UBF8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PI4KBQ9UBF8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PI4KBQ9UBF8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PI4KBQ9UBF8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PI4KBQ9UBF8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PI4KBQ9UBF8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PI4KBQ9UBF8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PI4KBQ9UBF8 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PI4KBQ9UBF8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PI4KBQ9UBF8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PI4KBQ9UBF8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PI4KBQ9UBF8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PI4KBQ9UBF8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PI4KBQ9UBF8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PI4KBQ9UBF8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PI4KBQ9UBF8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PI4KBQ9UBF8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PI4KBQ9UBF8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PI4KBQ9UBF8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PI4KBQ9UBF8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PI4KBQ9UBF8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PI4KBQ9UBF8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PI4KBQ9UBF8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PI4KBQ9UBF8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PI4KBQ9UBF8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PI4KBQ9UBF8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PI4KBQ9UBF8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PI4KBQ9UBF8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PI4KBQ9UBF8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PI4KBQ9UBF8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PI4KBQ9UBF8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PI4KBQ9UBF8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PI4KBQ9UBF8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PI4KBQ9UBF8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PI4KBQ9UBF8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PI4KBQ9UBF8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PI4KBQ9UBF8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PI4KBQ9UBF8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PI4KBQ9UBF8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PI4KBQ9UBF8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms