Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmb3Q9R1P1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms