Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ88

Vps29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps29Q9QZ88 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps29Q9QZ88 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps29Q9QZ88 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps29Q9QZ88 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps29Q9QZ88 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps29Q9QZ88 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps29Q9QZ88 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps29Q9QZ88 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps29Q9QZ88 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps29Q9QZ88 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps29Q9QZ88 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps29Q9QZ88 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps29Q9QZ88 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps29Q9QZ88 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps29Q9QZ88 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps29Q9QZ88 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps29Q9QZ88 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps29Q9QZ88 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps29Q9QZ88 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps29Q9QZ88 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps29Q9QZ88 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps29Q9QZ88 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps29Q9QZ88 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps29Q9QZ88 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps29Q9QZ88 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps29Q9QZ88 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vps29Q9QZ88 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps29Q9QZ88 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps29Q9QZ88 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps29Q9QZ88 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps29Q9QZ88 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps29Q9QZ88 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps29Q9QZ88 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps29Q9QZ88 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps29Q9QZ88 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps29Q9QZ88 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps29Q9QZ88 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps29Q9QZ88 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps29Q9QZ88 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps29Q9QZ88 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps29Q9QZ88 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps29Q9QZ88 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps29Q9QZ88 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps29Q9QZ88 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps29Q9QZ88 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps29Q9QZ88 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps29Q9QZ88 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps29Q9QZ88 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps29Q9QZ88 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps29Q9QZ88 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps29Q9QZ88 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps29Q9QZ88 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps29Q9QZ88 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps29Q9QZ88 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps29Q9QZ88 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps29Q9QZ88 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps29Q9QZ88 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps29Q9QZ88 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps29Q9QZ88 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps29Q9QZ88 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps29Q9QZ88 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps29Q9QZ88 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps29Q9QZ88 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps29Q9QZ88 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps29Q9QZ88 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps29Q9QZ88 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps29Q9QZ88 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps29Q9QZ88 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps29Q9QZ88 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps29Q9QZ88 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps29Q9QZ88 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps29Q9QZ88 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps29Q9QZ88 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps29Q9QZ88 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps29Q9QZ88 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps29Q9QZ88 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps29Q9QZ88 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps29Q9QZ88 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps29Q9QZ88 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps29Q9QZ88 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps29Q9QZ88 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps29Q9QZ88 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps29Q9QZ88 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps29Q9QZ88 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps29Q9QZ88 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps29Q9QZ88 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps29Q9QZ88 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps29Q9QZ88 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps29Q9QZ88 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps29Q9QZ88 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps29Q9QZ88 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps29Q9QZ88 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps29Q9QZ88 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps29Q9QZ88 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps29Q9QZ88 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps29Q9QZ88 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vps29Q9QZ88 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vps29Q9QZ88 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vps29Q9QZ88 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Vps29Q9QZ88 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms