Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CENPMQ9NSP4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPMQ9NSP4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms