Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LHX9Q9NQ69 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms