Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tlr5Q9JLF7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tlr5Q9JLF7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tlr5Q9JLF7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tlr5Q9JLF7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tlr5Q9JLF7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tlr5Q9JLF7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tlr5Q9JLF7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tlr5Q9JLF7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tlr5Q9JLF7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tlr5Q9JLF7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tlr5Q9JLF7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tlr5Q9JLF7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tlr5Q9JLF7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tlr5Q9JLF7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tlr5Q9JLF7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tlr5Q9JLF7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tlr5Q9JLF7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tlr5Q9JLF7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tlr5Q9JLF7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Tlr5Q9JLF7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tlr5Q9JLF7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Tlr5Q9JLF7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tlr5Q9JLF7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tlr5Q9JLF7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tlr5Q9JLF7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tlr5Q9JLF7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tlr5Q9JLF7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tlr5Q9JLF7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tlr5Q9JLF7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tlr5Q9JLF7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tlr5Q9JLF7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tlr5Q9JLF7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tlr5Q9JLF7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tlr5Q9JLF7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tlr5Q9JLF7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tlr5Q9JLF7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tlr5Q9JLF7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tlr5Q9JLF7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Tlr5Q9JLF7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tlr5Q9JLF7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tlr5Q9JLF7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tlr5Q9JLF7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tlr5Q9JLF7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tlr5Q9JLF7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tlr5Q9JLF7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tlr5Q9JLF7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tlr5Q9JLF7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tlr5Q9JLF7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tlr5Q9JLF7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tlr5Q9JLF7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tlr5Q9JLF7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Tlr5Q9JLF7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tlr5Q9JLF7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tlr5Q9JLF7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tlr5Q9JLF7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tlr5Q9JLF7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tlr5Q9JLF7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tlr5Q9JLF7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tlr5Q9JLF7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tlr5Q9JLF7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tlr5Q9JLF7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tlr5Q9JLF7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tlr5Q9JLF7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tlr5Q9JLF7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Tlr5Q9JLF7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tlr5Q9JLF7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tlr5Q9JLF7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tlr5Q9JLF7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tlr5Q9JLF7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Tlr5Q9JLF7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tlr5Q9JLF7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tlr5Q9JLF7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tlr5Q9JLF7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tlr5Q9JLF7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tlr5Q9JLF7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tlr5Q9JLF7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tlr5Q9JLF7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tlr5Q9JLF7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tlr5Q9JLF7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Tlr5Q9JLF7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tlr5Q9JLF7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tlr5Q9JLF7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tlr5Q9JLF7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Tlr5Q9JLF7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tlr5Q9JLF7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Tlr5Q9JLF7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tlr5Q9JLF7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tlr5Q9JLF7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tlr5Q9JLF7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tlr5Q9JLF7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tlr5Q9JLF7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tlr5Q9JLF7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Tlr5Q9JLF7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tlr5Q9JLF7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tlr5Q9JLF7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tlr5Q9JLF7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tlr5Q9JLF7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tlr5Q9JLF7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tlr5Q9JLF7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms