Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Alyref2Q9JJW6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Alyref2Q9JJW6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Alyref2Q9JJW6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Alyref2Q9JJW6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Alyref2Q9JJW6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Alyref2Q9JJW6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Alyref2Q9JJW6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Alyref2Q9JJW6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Alyref2Q9JJW6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Alyref2Q9JJW6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Alyref2Q9JJW6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Alyref2Q9JJW6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms