Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmbr1Q9JIT0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmbr1Q9JIT0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmbr1Q9JIT0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmbr1Q9JIT0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmbr1Q9JIT0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmbr1Q9JIT0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmbr1Q9JIT0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmbr1Q9JIT0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmbr1Q9JIT0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmbr1Q9JIT0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmbr1Q9JIT0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmbr1Q9JIT0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmbr1Q9JIT0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmbr1Q9JIT0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmbr1Q9JIT0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmbr1Q9JIT0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmbr1Q9JIT0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmbr1Q9JIT0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmbr1Q9JIT0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmbr1Q9JIT0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmbr1Q9JIT0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmbr1Q9JIT0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmbr1Q9JIT0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmbr1Q9JIT0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmbr1Q9JIT0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmbr1Q9JIT0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmbr1Q9JIT0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lmbr1Q9JIT0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lmbr1Q9JIT0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lmbr1Q9JIT0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Lmbr1Q9JIT0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lmbr1Q9JIT0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmbr1Q9JIT0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms