Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCR2

Ap3s1, AP-3 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s1Q9DCR2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ap3s1Q9DCR2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ap3s1Q9DCR2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ap3s1Q9DCR2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ap3s1Q9DCR2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ap3s1Q9DCR2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ap3s1Q9DCR2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ap3s1Q9DCR2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ap3s1Q9DCR2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ap3s1Q9DCR2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ap3s1Q9DCR2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ap3s1Q9DCR2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ap3s1Q9DCR2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ap3s1Q9DCR2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ap3s1Q9DCR2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ap3s1Q9DCR2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ap3s1Q9DCR2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap3s1Q9DCR2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap3s1Q9DCR2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap3s1Q9DCR2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap3s1Q9DCR2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap3s1Q9DCR2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap3s1Q9DCR2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap3s1Q9DCR2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap3s1Q9DCR2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap3s1Q9DCR2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap3s1Q9DCR2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap3s1Q9DCR2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap3s1Q9DCR2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap3s1Q9DCR2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap3s1Q9DCR2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap3s1Q9DCR2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ap3s1Q9DCR2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ap3s1Q9DCR2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ap3s1Q9DCR2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ap3s1Q9DCR2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ap3s1Q9DCR2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ap3s1Q9DCR2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ap3s1Q9DCR2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ap3s1Q9DCR2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ap3s1Q9DCR2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ap3s1Q9DCR2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ap3s1Q9DCR2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ap3s1Q9DCR2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ap3s1Q9DCR2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ap3s1Q9DCR2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ap3s1Q9DCR2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ap3s1Q9DCR2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ap3s1Q9DCR2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ap3s1Q9DCR2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ap3s1Q9DCR2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ap3s1Q9DCR2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ap3s1Q9DCR2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ap3s1Q9DCR2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ap3s1Q9DCR2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ap3s1Q9DCR2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ap3s1Q9DCR2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ap3s1Q9DCR2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ap3s1Q9DCR2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ap3s1Q9DCR2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ap3s1Q9DCR2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ap3s1Q9DCR2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ap3s1Q9DCR2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ap3s1Q9DCR2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ap3s1Q9DCR2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ap3s1Q9DCR2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ap3s1Q9DCR2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ap3s1Q9DCR2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ap3s1Q9DCR2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ap3s1Q9DCR2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ap3s1Q9DCR2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ap3s1Q9DCR2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ap3s1Q9DCR2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.7 ms