Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBX3

Susd2, Sushi domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd2Q9DBX3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Susd2Q9DBX3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Susd2Q9DBX3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Susd2Q9DBX3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Susd2Q9DBX3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Susd2Q9DBX3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Susd2Q9DBX3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Susd2Q9DBX3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Susd2Q9DBX3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Susd2Q9DBX3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Susd2Q9DBX3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Susd2Q9DBX3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Susd2Q9DBX3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Susd2Q9DBX3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Susd2Q9DBX3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Susd2Q9DBX3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Susd2Q9DBX3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Susd2Q9DBX3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Susd2Q9DBX3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Susd2Q9DBX3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Susd2Q9DBX3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Susd2Q9DBX3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Susd2Q9DBX3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Susd2Q9DBX3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Susd2Q9DBX3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Susd2Q9DBX3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Susd2Q9DBX3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Susd2Q9DBX3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Susd2Q9DBX3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Susd2Q9DBX3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Susd2Q9DBX3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Susd2Q9DBX3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Susd2Q9DBX3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Susd2Q9DBX3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Susd2Q9DBX3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Susd2Q9DBX3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Susd2Q9DBX3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Susd2Q9DBX3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Susd2Q9DBX3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Susd2Q9DBX3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Susd2Q9DBX3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Susd2Q9DBX3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd2Q9DBX3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd2Q9DBX3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Susd2Q9DBX3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd2Q9DBX3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd2Q9DBX3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd2Q9DBX3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Susd2Q9DBX3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd2Q9DBX3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd2Q9DBX3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd2Q9DBX3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd2Q9DBX3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd2Q9DBX3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Susd2Q9DBX3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Susd2Q9DBX3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Susd2Q9DBX3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Susd2Q9DBX3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Susd2Q9DBX3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Susd2Q9DBX3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Susd2Q9DBX3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Susd2Q9DBX3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Susd2Q9DBX3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Susd2Q9DBX3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Susd2Q9DBX3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Susd2Q9DBX3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Susd2Q9DBX3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Susd2Q9DBX3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Susd2Q9DBX3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Susd2Q9DBX3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Susd2Q9DBX3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Susd2Q9DBX3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Susd2Q9DBX3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Susd2Q9DBX3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Susd2Q9DBX3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Susd2Q9DBX3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Susd2Q9DBX3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Susd2Q9DBX3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Susd2Q9DBX3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Susd2Q9DBX3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Susd2Q9DBX3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Susd2Q9DBX3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Susd2Q9DBX3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Susd2Q9DBX3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Susd2Q9DBX3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Susd2Q9DBX3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Susd2Q9DBX3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Susd2Q9DBX3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Susd2Q9DBX3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Susd2Q9DBX3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Susd2Q9DBX3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms