Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms