Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H2

Cldnd2, Claudin domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldnd2Q9D9H2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms