Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5J6

Shpk, Sedoheptulokinase, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShpkQ9D5J6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ShpkQ9D5J6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms