Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH8

Ccdc77, Coiled-coil domain-containing protein 77, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc77Q9CZH8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc77Q9CZH8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc77Q9CZH8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc77Q9CZH8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc77Q9CZH8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc77Q9CZH8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc77Q9CZH8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc77Q9CZH8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc77Q9CZH8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc77Q9CZH8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc77Q9CZH8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc77Q9CZH8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc77Q9CZH8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc77Q9CZH8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc77Q9CZH8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc77Q9CZH8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc77Q9CZH8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc77Q9CZH8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc77Q9CZH8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc77Q9CZH8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc77Q9CZH8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc77Q9CZH8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc77Q9CZH8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc77Q9CZH8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc77Q9CZH8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc77Q9CZH8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc77Q9CZH8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc77Q9CZH8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc77Q9CZH8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc77Q9CZH8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc77Q9CZH8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc77Q9CZH8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc77Q9CZH8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc77Q9CZH8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc77Q9CZH8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc77Q9CZH8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc77Q9CZH8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc77Q9CZH8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc77Q9CZH8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc77Q9CZH8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc77Q9CZH8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc77Q9CZH8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc77Q9CZH8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc77Q9CZH8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc77Q9CZH8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc77Q9CZH8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc77Q9CZH8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc77Q9CZH8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc77Q9CZH8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc77Q9CZH8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc77Q9CZH8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc77Q9CZH8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc77Q9CZH8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc77Q9CZH8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc77Q9CZH8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc77Q9CZH8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc77Q9CZH8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc77Q9CZH8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc77Q9CZH8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms