Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWZ3

Rbm8a, RNA-binding protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm8aQ9CWZ3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbm8aQ9CWZ3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbm8aQ9CWZ3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbm8aQ9CWZ3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbm8aQ9CWZ3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbm8aQ9CWZ3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbm8aQ9CWZ3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbm8aQ9CWZ3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbm8aQ9CWZ3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbm8aQ9CWZ3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbm8aQ9CWZ3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbm8aQ9CWZ3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbm8aQ9CWZ3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rbm8aQ9CWZ3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rbm8aQ9CWZ3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rbm8aQ9CWZ3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rbm8aQ9CWZ3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rbm8aQ9CWZ3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rbm8aQ9CWZ3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rbm8aQ9CWZ3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms