Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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