Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ70

TCF25, Transcription factor 25, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF25Q9BQ70 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TCF25Q9BQ70 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TCF25Q9BQ70 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TCF25Q9BQ70 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCF25Q9BQ70 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCF25Q9BQ70 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCF25Q9BQ70 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCF25Q9BQ70 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCF25Q9BQ70 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCF25Q9BQ70 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCF25Q9BQ70 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCF25Q9BQ70 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCF25Q9BQ70 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCF25Q9BQ70 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCF25Q9BQ70 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCF25Q9BQ70 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCF25Q9BQ70 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCF25Q9BQ70 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCF25Q9BQ70 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCF25Q9BQ70 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCF25Q9BQ70 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCF25Q9BQ70 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCF25Q9BQ70 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCF25Q9BQ70 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCF25Q9BQ70 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCF25Q9BQ70 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCF25Q9BQ70 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCF25Q9BQ70 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCF25Q9BQ70 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCF25Q9BQ70 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCF25Q9BQ70 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCF25Q9BQ70 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCF25Q9BQ70 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCF25Q9BQ70 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCF25Q9BQ70 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCF25Q9BQ70 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TCF25Q9BQ70 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCF25Q9BQ70 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCF25Q9BQ70 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCF25Q9BQ70 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCF25Q9BQ70 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCF25Q9BQ70 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCF25Q9BQ70 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCF25Q9BQ70 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCF25Q9BQ70 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCF25Q9BQ70 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCF25Q9BQ70 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCF25Q9BQ70 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCF25Q9BQ70 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TCF25Q9BQ70 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCF25Q9BQ70 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCF25Q9BQ70 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCF25Q9BQ70 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCF25Q9BQ70 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCF25Q9BQ70 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCF25Q9BQ70 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCF25Q9BQ70 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCF25Q9BQ70 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCF25Q9BQ70 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCF25Q9BQ70 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCF25Q9BQ70 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCF25Q9BQ70 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCF25Q9BQ70 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCF25Q9BQ70 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCF25Q9BQ70 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCF25Q9BQ70 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCF25Q9BQ70 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCF25Q9BQ70 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCF25Q9BQ70 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCF25Q9BQ70 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCF25Q9BQ70 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCF25Q9BQ70 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCF25Q9BQ70 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCF25Q9BQ70 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCF25Q9BQ70 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCF25Q9BQ70 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCF25Q9BQ70 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TCF25Q9BQ70 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TCF25Q9BQ70 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCF25Q9BQ70 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCF25Q9BQ70 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCF25Q9BQ70 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCF25Q9BQ70 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCF25Q9BQ70 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCF25Q9BQ70 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TCF25Q9BQ70 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TCF25Q9BQ70 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCF25Q9BQ70 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCF25Q9BQ70 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCF25Q9BQ70 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCF25Q9BQ70 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCF25Q9BQ70 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCF25Q9BQ70 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCF25Q9BQ70 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCF25Q9BQ70 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TCF25Q9BQ70 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TCF25Q9BQ70 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCF25Q9BQ70 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCF25Q9BQ70 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCF25Q9BQ70 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms