Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cstf3Q99LI7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms