Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Abcf2Q99LE6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Abcf2Q99LE6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Abcf2Q99LE6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Abcf2Q99LE6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Abcf2Q99LE6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Abcf2Q99LE6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Abcf2Q99LE6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Abcf2Q99LE6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Abcf2Q99LE6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Abcf2Q99LE6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Abcf2Q99LE6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Abcf2Q99LE6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Abcf2Q99LE6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Abcf2Q99LE6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Abcf2Q99LE6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Abcf2Q99LE6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Abcf2Q99LE6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Abcf2Q99LE6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Abcf2Q99LE6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Abcf2Q99LE6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Abcf2Q99LE6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Abcf2Q99LE6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Abcf2Q99LE6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Abcf2Q99LE6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Abcf2Q99LE6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Abcf2Q99LE6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Abcf2Q99LE6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Abcf2Q99LE6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Abcf2Q99LE6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Abcf2Q99LE6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Abcf2Q99LE6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Abcf2Q99LE6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Abcf2Q99LE6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Abcf2Q99LE6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Abcf2Q99LE6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Abcf2Q99LE6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Abcf2Q99LE6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Abcf2Q99LE6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Abcf2Q99LE6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Abcf2Q99LE6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Abcf2Q99LE6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Abcf2Q99LE6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Abcf2Q99LE6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Abcf2Q99LE6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Abcf2Q99LE6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Abcf2Q99LE6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Abcf2Q99LE6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Abcf2Q99LE6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Abcf2Q99LE6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Abcf2Q99LE6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Abcf2Q99LE6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Abcf2Q99LE6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcf2Q99LE6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcf2Q99LE6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcf2Q99LE6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcf2Q99LE6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcf2Q99LE6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcf2Q99LE6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcf2Q99LE6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcf2Q99LE6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcf2Q99LE6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcf2Q99LE6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcf2Q99LE6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcf2Q99LE6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcf2Q99LE6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcf2Q99LE6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcf2Q99LE6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcf2Q99LE6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcf2Q99LE6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcf2Q99LE6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcf2Q99LE6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcf2Q99LE6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcf2Q99LE6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Abcf2Q99LE6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Abcf2Q99LE6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Abcf2Q99LE6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Abcf2Q99LE6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Abcf2Q99LE6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Abcf2Q99LE6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Abcf2Q99LE6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Abcf2Q99LE6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Abcf2Q99LE6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Abcf2Q99LE6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Abcf2Q99LE6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Abcf2Q99LE6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Abcf2Q99LE6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Abcf2Q99LE6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Abcf2Q99LE6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Abcf2Q99LE6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Abcf2Q99LE6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Abcf2Q99LE6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Abcf2Q99LE6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Abcf2Q99LE6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Abcf2Q99LE6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Abcf2Q99LE6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Abcf2Q99LE6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Abcf2Q99LE6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Abcf2Q99LE6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Abcf2Q99LE6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms