Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY1

Tirap, Toll/interleukin-1 receptor domain-containing adapter protein, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TirapQ99JY1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TirapQ99JY1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TirapQ99JY1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TirapQ99JY1 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TirapQ99JY1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TirapQ99JY1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TirapQ99JY1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TirapQ99JY1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TirapQ99JY1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TirapQ99JY1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TirapQ99JY1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TirapQ99JY1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TirapQ99JY1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TirapQ99JY1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TirapQ99JY1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TirapQ99JY1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TirapQ99JY1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TirapQ99JY1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TirapQ99JY1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TirapQ99JY1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TirapQ99JY1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TirapQ99JY1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TirapQ99JY1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TirapQ99JY1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TirapQ99JY1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TirapQ99JY1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TirapQ99JY1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TirapQ99JY1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TirapQ99JY1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TirapQ99JY1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TirapQ99JY1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TirapQ99JY1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TirapQ99JY1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TirapQ99JY1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TirapQ99JY1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TirapQ99JY1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TirapQ99JY1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TirapQ99JY1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TirapQ99JY1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TirapQ99JY1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TirapQ99JY1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TirapQ99JY1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TirapQ99JY1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TirapQ99JY1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TirapQ99JY1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TirapQ99JY1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TirapQ99JY1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TirapQ99JY1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TirapQ99JY1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TirapQ99JY1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TirapQ99JY1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TirapQ99JY1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TirapQ99JY1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TirapQ99JY1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TirapQ99JY1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TirapQ99JY1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TirapQ99JY1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TirapQ99JY1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TirapQ99JY1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TirapQ99JY1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TirapQ99JY1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TirapQ99JY1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TirapQ99JY1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TirapQ99JY1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TirapQ99JY1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TirapQ99JY1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TirapQ99JY1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TirapQ99JY1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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TirapQ99JY1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TirapQ99JY1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TirapQ99JY1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TirapQ99JY1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TirapQ99JY1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TirapQ99JY1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TirapQ99JY1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TirapQ99JY1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TirapQ99JY1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TirapQ99JY1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TirapQ99JY1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TirapQ99JY1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TirapQ99JY1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TirapQ99JY1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TirapQ99JY1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TirapQ99JY1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TirapQ99JY1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TirapQ99JY1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TirapQ99JY1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TirapQ99JY1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TirapQ99JY1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TirapQ99JY1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TirapQ99JY1 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TirapQ99JY1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TirapQ99JY1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TirapQ99JY1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TirapQ99JY1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TirapQ99JY1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TirapQ99JY1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TirapQ99JY1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TirapQ99JY1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms