Protein–RNA interactions for Protein: Q99JN2

Klhl22, Kelch-like protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl22Q99JN2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms